在气相色谱的使用过程中，氢气的用途主要有以下几种：一方面使用氢气作为气相色谱分析的载气，进行样品分离和分析；另一方面，当使用毛细柱进行分析时，一般需要使用与载气相同的气体作为尾吹气；再则，使用FID、FPD和NPD做检测器时候，需要使用氢气作为燃气，和空气燃烧以提供火焰；此外，当仪器使用转化炉时候，需要额外的氢气用作反应气体和CO、CO2发生反应生成甲烷。常用的氢气供给方式包括使用钢瓶氢气和使用氢气发生器来提供。出于安全考虑，不少的实验室目前使用氢气发生器进行供气。除了安全的特点之外，气体发生器可以放在仪器旁边，避免了布置气路管道等问题。
实验室常用的氢气发生器是采用碱性电解槽+硅胶/分子筛净化系统的氢气发生器（点击链接，查看详细内容：第08篇气相色谱中的氢气发生器），使用之前向氢气发生器的电解液储液桶加入合适量的KOH水溶液，连接好仪器管路，打开开关即可长期使用。
正常使用时候，应当保持氢气发生器液位在上下液位线之间；当氢气发生器正常工作时，氢气发生器输出流量会显示仪器实际使用的氢气流量（大致示数，有偏差）；如果未使用氢气，输出流量示数为0，且电解指示灯不亮。
使用氢气发生器时，打开电源开关之后，流量示数往往很大，显示为该装置的z大产气量，往往会引起对氢气发生器仪器状态的疑虑。
实际上，打开氢气发生器之后，为了达到氢气发生器本身预设的氢气输出压力，其会以z大的功率电解水产氢；由z大电解水功率计算为氢气流量，显示在示数上则为该氢气发生器的z大输出流量。待达到氢气发生器本身预设的输出压力之后，输出流量示数则为实际使用的氢气流量。
在室温情况下，打开氢气发生器，6min左右即可达到输出压力设定值；如果室温较低（冬季），则需要更长的时间。
当然，如果长时间氢气发生器达不到预定的输出压力，或仪器显示输出流量超出实际使用量较大/持续显示为z大输出流量，则需要排查仪器故障。常见的仪器故障为气路系统漏气、氢气发生器的过滤器或过滤器上盖没有拧紧、氢气电解池反漏等。
气路系统漏气指的是氢气发生器与气相色谱连接的管线可能漏气，此时需要拧紧管路连接的螺帽、更换管路密封O型圈、压环等。
氢气发生器常使用硅胶/分子筛来净化电解产生的氢气，如果更换了净化用的硅胶和分子筛，或长期使用导致密封不严、密封圈老化，可能会漏气。
